El programa educativo del Museo está montado sobre la base del trabajo pedagógico de un grupo de profesionales, docentes y diseñadores que planifican las actividades, con el objeto de brindar a los visitantes una agradable experiencia educativa, estimular el interés, incrementar el conocimiento y promover el cuidado de los océanos a través de la educación, exhibiciones e investigación.

Las actividades educativas del Museo también abarcan la implementación de eventos complementarios, tales como visitas escolares, workshops y clases, conferencias, programas de voluntarios, proyecciones y publicaciones, que proveerán la información necesaria sobre las exhibiciones y tareas del Museo. Los programas pedagógicos a implementar en los niveles Preescolar, EPB y Polimodal, están basados en las currículas y planes educativos en Ciencias Naturales y su relación con otras disciplinas afines, como Ciencias Sociales, Tecnología, Geografía y Geología.

Para los más chicos, el Museo tiene planeado un Teatro de Marionetas para aprender en forma divertida. Nuestra intención es trabajar en equipo con docentes y autoridades educativas del área oficial y privada a fin de comunicar y formar a los estudiantes con el mayor nivel de conocimiento y de amor por nuestro mar.

Nuestro objetivo está orientado hacia la formación integral de los estudiantes a través de actividades interdisciplinarias, las cuales acentúan el carácter complejo de la realidad y de la interdependencia de las cosas.